长冈京(784-794)784年，寒武天皇从平城（现在的奈良）迁出政府所在地后，长冈京成为日本的首都。天皇偏爱长冈京的原因是河流的存在，可以提供良好的水运。然而，这些河流是城市衰败的原因，因为它们经常泛滥并将水传播疾病传播给居民，最终迫使天皇在794年将首都迁至平安京。
京都(794-1868)
京都最初被称为平安京，一千多年来一直是日本的首都。公元794年，寒武天皇将政府所在地从长冈京迁至京都后，京都获得了首都地位。皇帝以中国古代城市长安为蓝本，以宽阔的街道（有些超过78英尺）对城市进行了适当的规划。挖了两条人工运河，为居民提供了稳定的供水，也保护了城市免受洪水侵袭。几个世纪以来，平安京饱受火灾的困扰，在1467-1477年的Onin战争期间几乎被烧毁。17世纪初德川幕府的崛起最终导致政府所在地在1608年转移到江户。然而，京都一直是正式的首都，直到1868年江户更名为东京。
江户(1608-1868)
江户是德川藩封建军事统治时期的政府所在地，因此在1608年至1868年间成为日本事实上的首都。德川在城内建造了江户城，这是“幕府将军”的官邸。江户城是围绕城堡发展起来的，并迅速从一个不起眼的渔村发展成为18世纪世界上最大的城市中心。德川幕府在城市的管理和规划方面非常有效，因为它设立了在刑事和民事纠纷中担任法官的行政人员，还设立了城市消防部门。消防部门至关重要，因为江户曾遭受无数灾难性火灾的困扰，其中包括1657年的Meireki大火，估计有100,000人丧生。虽然江户是政治权力中心和事实上的首都，但京都仍然被公认为日本的官方首都。1868年，德川幕府统治结束，江户改名为东京，并保持其作为该国事实上的首都的作用。
东京（1868年至今）
1867年德川幕府覆灭后，日本在17岁的明治天皇领导下经历了重大改革，包括1868年江户更名为东京，江户城更名为皇居。这座城市发展成为世界主要城市之一，也是许多行业的中心。东京都市区也是世界上人口最多的地区，约有4000万居民。
法律说明
虽然东京被认为是日本的首都，但该国没有明确赋予东京这一区别的法律。因此，东京被认为是日本事实上的首都而不是法律上的首都。
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